可以说，六个总督只有两广总督商周祚被留下来，其余五个都要调换。
这个动静实在太大，以至于群臣纷纷求情，不能一下子处罚这么多官员。
朱由检只是在气头上，才一口气把这些建祠主犯罗列出来。
听到群臣求情，他也觉得地方变动太大不好，说道：
“天津巡抚总督辽饷黄运泰、凤阳巡抚漕运总督郭尚友、专督河道侍郎李从心、三边总督史永安、延绥巡抚朱童蒙。”
“这五人视其以往功绩暂且留任，如能解决边饷问题，以后降低逆案等级从轻发落。”
“其余人定为第五等，罚没非法收入以充边饷，如有隐瞒直接抄家。”
兵部右侍郎吕纯如为袁崇焕求情，说道：
“袁崇焕多有功绩，其人不怕死不爱钱，恳请从轻发落。”
这些日子为袁崇焕求情的人不少，朱由检考虑到他还有些能力，没有坚持把他定在第五等永不叙用，决定从轻发落。
不过这个人胆子实在太大，以后擅自砍了毛文龙不说，之前被罢免的一个原因就是因为擅自和后金议和，被辽东督师王之臣等弹劾。
袁可立也因为这件事“辱国非计”，被魏忠贤认为有可能坏了袁崇焕的功劳、影响魏良卿封爵，把袁可立廷推到南京致仕。
所以袁崇焕这个人，朱由检是不敢再把他放到辽东前线的。
想到援蜀副总兵江起龙也请求启用袁崇焕，朱由检道：
“湖广巡抚姚宗文被拿下，需要有人代替。”