凌凡在“真知之塔”获得了“牧者之章”的大概位置，在位于XM市的近海之中。
他再次进行查询牧者长袍第4层的封印物品，真知之塔表示无法查询。
同时，凌凡帮助罪恶之城平息了变异兽潮的动乱，在一座小县城的体育场里消失了一直六阶毒蚊子，找到了生长于宝箱堆的“天材地宝”，获得了治愈细胞微小创造的药材，完恢复了罡狮子一战中的伤势。
在获得了“血复玉果”制成的药品之后，凌凡启程前往XM市。
中途他遇见了两个人类领地为了抢夺资源，在变异兽的的威胁之下依旧在相互内斗，这让凌凡猛然意识到，即使第二天人类部毁灭，前日的晚上人类依旧会内斗不休，这让凌凡决心加快“人类命运共同体联盟”的进程。
凌凡进入XM市的近海，这里有一处“人类百强之一”的大型领地，凌凡要求他并入启明之城。
之后，凌凡为了应对威胁，契约兽第8只十阶水系契约兽，与海中的变异生物进行一番友好交流后获得牧者之章，解封装备。
同时凌凡在海中获得一块古老的羊皮碎片，古老的黑影再度出现，告诉他人类的希望就在完整的羊皮纸上，凌凡触发任务凑齐5块羊皮碎片，发现碎片竟然都位于“变异兽大禁区”之中，那是前世人类没有踏足过的地方，曾经灭绝了一个又一个想要入侵的异种。
原来对抗异种的过程中，变异兽才是主力，人类不过是夹缝中求生存罢了。
之后凌凡接到施月明的通讯，启明之城要升级5级，5级领地是分水岭，有“堡垒”“学院”“贸易中心”等等升级选项，凌凡通过定点传送卷轴回去，将启明之城升级为“学院形态”，加速各种技能的研究速度，以便让自己快速变强。
同时开始建造传送阵。
之后启明之城开启扩张，吞并了一个又一个领地，将ZJ沿海都纳入了领地范围。
3年后，凌凡升到60级，开启第三次转职任务。
传送阵建造完成。
同时系统更新，地球大陆解除了新手村保护，像一艘轮船融入港湾一样，地球大陆融入了哥布林大陆中。